В апреле 1941 года назначен адъютантом танкового батальона 147-го отдельного танкового полка 103-й моторизованной дивизии Северо-Кавказского военного округа (Ворошиловск).
В начале Великой Отечественной войны дивизия была спешно переброшена на Западный фронт.
В июле 1941 года Гусаковский вступил в первый бой под Ельней в составе пехотного подразделения.
С августа 1941 — начальник штаба 147-го танкового полка, с сентября 1941 — начальник штаба 688-го мотострелкового полка в той же дивизии. Дивизия воевала в рядах 24-й армии.
В ноябре 1941 года полк был расформирован, а Гусаковский был назначен начальником штаба 131-го отдельного танкового батальона 50-й армии. В этот период участвовал в Смоленском оборонительном сражении, Ельнинской наступательной операции, в битве за Москву (Тульская оборонительная и Тульская наступательная операции, в освобождении города Юхнов).
С февраля 1942 — заместитель начальника штаба по оперативной работе, с апреля 1942 — начальник штаба 112-й танковой бригады в 50-й армии Западного фронта.
В августе 1943 года в ходе Курской битвы на поле боя под Обоянью заменил убитого командира бригады Леонова и исполнял его обязанности, а в сентябре 1943 года был официально утверждён в должности командира этой бригады (в октябре 1943-го года за отличия в боях бригаде было присвоено гвардейское звание и она стала именоваться — 44-я гвардейская танковая бригада). Находилась в составе 11-й гвардейского танкового корпуса. В начале 1943 года бригаде было передано в дар 53 танка (32 танка Т-34 и 21 Т-70), построенных на средства, собранные монгольским народом (один из танков, дошедший до Берлина, ныне установлен у подножия холма Зайсан в столице Монголии Улан-Баторе, а на холме находится памятник советским воинам).
17 июля 1944 года под его командованием бригада форсировала Западный Буг.
За умелое руководство бригадой (1-я гвардейская танковая армия, 1-й Украинский фронт) в ходе Львовско-Сандомирской операции, личное мужество, отвагу и героизм гвардии полковнику И. И. Гусаковскому 23 сентября 1944 года было присвоено звание Герой Советского Союза.
Вновь проявил выдающееся мастерство танкового командира и личную отвагу в ходе Висло-Одерской наступательной операции. 15 января бригада с боем форсировала реку Пилица и стремительно расширяя плацдарм, 17 января освободила город Лович (Польша). Оттуда бригада вошла в прорыв и действуя как передовой отряд танкового корпуса за последующие две недели января 1945 года с боями прошла впереди наступавших войск около 300 километров. В эти дни бригадой были освобождены 4 города и до 250 других населённых пунктов. Уничтожены 10 танков врага, 12 самоходных орудий, 59 бронетранспортеров и бронемашин, 43 орудия разных калибров и около 4000 солдат и офицеров противника. Захвачены 6 различных складов и свыше 130 пленных. За выдающиеся отвагу и геройство гвардии полковник И. И. Гусаковский 6 апреля 1945 года был награждён второй медалью «Золотая Звезда».
Под его командованием менее чем за 2 года участия в боях бригада получила гвардейское знамя, почётное наименование «Бердичевская», награждена пятью советскими и одним монгольским орденами. Ей объявлено 16 благодарностей Верховного Главнокомандующего. Начав войну старшим лейтенантом, И. Гусаковский окончил её полковником. Был дважды ранен (первое ранение получил 12 августа 1943 года у города Богодухов, второе тяжелое ранение получил 27 апреля 1945 года на улице Берлина).
Источник: https://ru.wikipedia.org/wiki/Гусаковский,_Иосиф_Ираклиевич